Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samhd1Q60710 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Samhd1Q60710 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms