Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc39dQ0VF76 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms