Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms