Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rab11bP46638 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rab11bP46638 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Rab11bP46638 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rab11bP46638 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rab11bP46638 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rab11bP46638 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rab11bP46638 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rab11bP46638 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rab11bP46638 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Rab11bP46638 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
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Rab11bP46638 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Rab11bP46638 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Rab11bP46638 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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