Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ggta1P23336 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ggta1P23336 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Ggta1P23336 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms