Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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