Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf518bB2RRE4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf518bB2RRE4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf518bB2RRE4 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf518bB2RRE4 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms