Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Prr16A3KMN5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Prr16A3KMN5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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Prr16A3KMN5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Prr16A3KMN5 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Prr16A3KMN5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Prr16A3KMN5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Prr16A3KMN5 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prr16A3KMN5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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