Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c4A2ANA3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c4A2ANA3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms