Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Fip1l1Q9D824 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms