Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1L0

Chchd2, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd2Q9D1L0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chchd2Q9D1L0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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