Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PsenenQ9CQR7 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms