Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim26Q99PN3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim26Q99PN3 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms