Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atp1b4Q99ME6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms