Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms