Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Upp2Q8CGR7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms