Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Vstm2lQ6PDS0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vstm2lQ6PDS0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms