Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Chd4Q6PDQ2 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms