Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mfsd13aQ6PDE8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms