Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdzrn3Q69ZS0 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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