Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

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Length 938 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sfmbt2Q5DTW2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sfmbt2Q5DTW2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms