Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sec31aQ3UPL0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sec31aQ3UPL0 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms