Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Arfgef3Q3UGY8 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Arfgef3Q3UGY8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms