Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Gm13201-201ENSMUST00000144031 600 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrriq1Q0P5X1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm13372-201ENSMUST00000123129 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Lrriq1Q0P5X1 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrriq1Q0P5X1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms