Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Cdx4Q07424 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms