Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms