Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Scn1bP97952 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms