Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psme1P97371 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms