Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ube2nP61089 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms