Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Cldn18P56857 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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