Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cd28P31041 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd28P31041 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd28P31041 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cd28P31041 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms