Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NfyaP23708 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms