Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SftpcP21841 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms