Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ptpn20O55082 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ptpn20O55082 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ptpn20O55082 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ptpn20O55082 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ptpn20O55082 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
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