Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp100O35892 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Sp100O35892 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sp100O35892 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms