Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gpc6Q9R087 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gpc6Q9R087 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Gpc6Q9R087 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gpc6Q9R087 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gpc6Q9R087 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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