Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Tspan4Q9DCK3 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Tspan4Q9DCK3 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Tspan4Q9DCK3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Tspan4Q9DCK3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Tspan4Q9DCK3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Tspan4Q9DCK3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Tspan4Q9DCK3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Tspan4Q9DCK3 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Tspan4Q9DCK3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Tspan4Q9DCK3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Tspan4Q9DCK3 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Tspan4Q9DCK3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Tspan4Q9DCK3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms