Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Med27Q9DB40 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Med27Q9DB40 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Med27Q9DB40 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms