Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Atl3Q91YH5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atl3Q91YH5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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