Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Klhdc3Q8VEM9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms