Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usp27Q8CEG8 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Usp27Q8CEG8 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp27Q8CEG8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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