Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim12Q78RX3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms