Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
NipblQ6KCD5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
NipblQ6KCD5 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
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