Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sbno1Q689Z5 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sbno1Q689Z5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sbno1Q689Z5 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sbno1Q689Z5 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms