Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm27Q5SFM8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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