Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms