Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U1D9 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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