Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vps8Q0P5W1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps8Q0P5W1 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms