Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gjb5Q02739 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gjb5Q02739 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms