Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cacna1cQ01815 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms